Принципът на микропомпата може да бъде разделен на няколко ключови части, за да се опише ясно, следното е подробно обяснение на нейния принцип:
Принцип на самозасмукване:
Микропомпата може да абсорбира вода без отклонение, което означава, че има функция за самозасмукване.
Когато помпената тръба на помпата е въздух, се използва отрицателното налягане (вакуум), образувано при работа на помпата, и налягането на водата под помпения отвор се повишава под действието на атмосферното налягане и след това се изпуска от дренажния край на помпата.
Струва си да се отбележи, че въпреки че някои микропомпи също имат капацитет на самозасмукване, тяхната максимална височина на самозасмукване може да се отнася само за височината на водата, която може да се вдигне „след добавяне на вода“, а не за истинския смисъл на самозасмукване .